南京工业大学设有安全科学与工程学院、环境科学与工程学院、应急管理学院、材料科学与工程学院、化工学院、化学与分子工程学院、电气工程与控制科学学院、机械与动力工程学院、能源科学与工程学院、药学院等学院。以下是具体名单一览表，仅供参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

1. 安全环境学部：安全科学与工程学院、环境科学与工程学院、应急管理学院

2. 材料科学学部：材料科学与工程学院

3. 化学化工学部：化工学院、化学与分子工程学院

4. 机械控制学部：电气工程与控制科学学院、机械与动力工程学院、能源科学与工程学院

5. 健康科技学部：药学院

6. 建筑艺术学部：建筑学院、艺术设计学院

7. 经济管理学部：经济与管理学院

8. 人文社科学部：法政学院、马克思主义学院、外国语言文学学院、体育学院

9. 生物制造学部：生物与制药工程学院、食品与轻工学院

10. 数理信息学部：计算机与信息工程学院（人工智能学院）、柔性电子（未来技术）学院、数理科学学院

11. 土木交通学部：测绘科学与技术学院、城市建设学院、交通运输工程学院、土木工程学院

12. 其他培养单位：2011学院、海外教育学院

南京工业大学坐落于江苏省南京市，是国家国防科技工业局、住房和城乡建设部与江苏省人民共建高校，入选多项国家级和省级项目，是江苏高水平大学建设重点支持高校、江苏省重点建设高校、江苏省综合评价录取改革试点高校、江苏省人才强校试点高校、国家首批深化创新创业教育改革示范高校、全国高校实践育人创新创业基地、全国首批来华留学质量认证高校、孔子学院奖学金接收院校、“卓越工程师教育培养计划”试点高校。

南京工业大学由南京化工大学和南京建筑工程学院合并组建，前者可追溯到创建于1902年的三江师范学堂，后者可追溯到创建于1915年的同济医工学堂机师科。