两年后，神秘的弑神之剑教团突然出现，同时出现大量原黑色骑士团成员的暗杀事件。红月卡莲身负重伤，修奈泽鲁的Geass能力被解除，他为了争夺王位开始秘密集结军队。与此娜娜莉也遭到刺杀，刺客竟然是一个年轻的少年。令人震惊的是，被抬走的刺客尸体随后消失了。

世界各地再次爆发战争，娜娜莉在梦中频繁梦见一个黑发少女。杰里米亚启动Geass能力消除器，解除了娜娜莉身上的另一个Geass。

原来鲁路修和娜娜莉还有一个不为人知的姐姐——第十六皇女莉露娜V不列颠。在娜娜莉年幼时，莉露娜因心肌不全去世。由于某种原因，关于她的存在被全部抹去。真相揭晓，原来十二年前，莉露娜与Code的持有者签订了契约，获得了Geass能力，可以将自己的意识附身于他人。不久后她病危，得到了契约者一半的Code，暂时封印在神根岛上。

不久前封印被解除，她和契约者一起成立了弑神之剑教团，目的是使用阿卡夏之剑完成玛丽安娜的愿望。行刺娜娜莉的人和解除修奈泽鲁的人竟然是同一人，她的契约者命令她暗杀原黑色骑士团成员。

在所有人都无法阻止第十六皇女准备启动阿卡夏之剑之时，出现在所有人面前的竟然是已经死去的鲁路修和失踪两年的C.C。尤菲米娅·Li·布里塔尼亚的故事也引人入胜，她的经历与枢木朱雀交织，充满了冒险、悲剧与希望。她的真诚与努力最终带来了什么结果呢？

《叛逆的鲁路修》这部动画中，主要角色如鲁路修·兰佩路基和枢木朱雀等人物的故事线也非常引人入胜。他们各自为了不同的目标而奋斗，面对复杂的局面和内心的挣扎，他们的选择将如何影响世界的未来？

推荐大家去看《叛逆的鲁路修》的官方小说以了解更多细节和背景故事。小说详细描述了玛丽安娜和CC的约定，以及克洛维斯一厢情愿的研究和送给皇上的礼物等情节。这些情节在动画中并未展现，只有通过阅读小说才能了解。希望大家通过阅读小说，更深入地了解这部动画的世界和角色。